Lo vas a tener que resolver con ajax. Desde javascript no podes acceder directamente a la base de datos.

ok gracias me podrias dar un ejemplo de como lo podria resolver?

Como bien dijo Gastón deberías usar Ajax para hacer la validación, ya que javascript se ejecuta en el cliente y no podrás acceder a la BD por medio de este lenguaje, necesitas hacer la validación en un lenguaje que se ejecute en el servidor como por ejemplo PHP, (no se con que lenguaje estás trabajando). El script escrito en PHP, deberá verificar en la BD si el ID existe o no y mostrar un texto indicándolo.

Por ejemplo:
$consulta = haces la consulta a la BD

if ($consulta){

echo 'existe';

}else{

echo 'no existe';

}

Recuerda que la respuesta de un AJAX siempre es texto.

Luego desde javascript lo que haces es crear un objeto de la clase XMLHttpRequest, este objeto es el que ejecutará el script escrito en PHP. Este objeto una vez que termine tendrá la respuesta que necesitas.

por ejemplo:

if (objetoAjax.responseText == 'no existe'){

    alert('Ese ID no existe!!');

    return false;

}

Claro que esto es solo un bosquejo, hay innumerables tutoriales de AJAX en la web que te ayudarán a completar lo que quieres, y verás que si bien el codigo parece algo complejo, una vez que te acostumbras es muy sencillo de utilizar para estas simples validaciones...

mucha suerte!

Si vas a usar ajax por primera vez, para facilitarte las cosas te recomiendo que uses alguna libreria como jquery.